Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS4Q9BT78 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS4Q9BT78 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms