Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A3Q9BRY0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms