Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED2Q99967 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED2Q99967 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CITED2Q99967 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms