Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEIS3Q99687 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEIS3Q99687 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms