Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP19Q99542 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms