Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SIN3AQ96ST3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms