Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTAGE1Q96RT6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms