Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARXQ96QS3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms