Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALS2CR12Q96Q35 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms