Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD1Q96JS3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms