Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LCORQ96JN0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LCORQ96JN0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms