Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC34Q96HJ3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms