Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms