Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC51Q96ER9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms