Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPDL1Q96EA4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPDL1Q96EA4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms