Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4CQ96DT6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4CQ96DT6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms