Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HPS3Q969F9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPS3Q969F9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms