Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HLA-CQ95604 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms