Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF25Q93038 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF25Q93038 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms