Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRF1Q92994 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms