Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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COPS9Q8WXC6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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COPS9Q8WXC6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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COPS9Q8WXC6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
COPS9Q8WXC6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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