Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms