Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERC6Q8IVU3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERC6Q8IVU3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms