Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC50Q8IVM0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC50Q8IVM0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms