Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC29A4Q7RTT9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC29A4Q7RTT9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms