Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL1

USP54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, humanhuman

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Length 1,684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54Q70EL1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP54Q70EL1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP54Q70EL1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
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