Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms