Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRSAM1Q6UWE0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRSAM1Q6UWE0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms