Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EDC4Q6P2E9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.4 ms