Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms