Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPPQ6IPU0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPPQ6IPU0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms