Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USPL1Q5W0Q7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms