Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SAMD13Q5VXD3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SAMD13Q5VXD3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SAMD13Q5VXD3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SAMD13Q5VXD3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SAMD13Q5VXD3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SAMD13Q5VXD3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SAMD13Q5VXD3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SAMD13Q5VXD3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SAMD13Q5VXD3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD13Q5VXD3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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