Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf135Q5VTT2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf135Q5VTT2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms