Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ODF2Q5BJF6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms