Protein–RNA interactions for Protein: Q53RT3

ASPRV1, Retroviral-like aspartic protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASPRV1Q53RT3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ASPRV1Q53RT3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASPRV1Q53RT3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms