Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf46Q504U0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf46Q504U0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms