Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP6Q3SY56 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SP6Q3SY56 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms