Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP24-1Q3LI83 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP24-1Q3LI83 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms