Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD55Q3KP44 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms