Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms