Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TWISTNBQ3B726 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms