Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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