Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC142Q17RM4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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