Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA9Q16790 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA9Q16790 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA9Q16790 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA9Q16790 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CA9Q16790 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA9Q16790 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA9Q16790 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA9Q16790 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA9Q16790 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CA9Q16790 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CA9Q16790 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA9Q16790 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CA9Q16790 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA9Q16790 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA9Q16790 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA9Q16790 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA9Q16790 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CA9Q16790 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA9Q16790 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA9Q16790 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CA9Q16790 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA9Q16790 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA9Q16790 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA9Q16790 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA9Q16790 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA9Q16790 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA9Q16790 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CA9Q16790 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CA9Q16790 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CA9Q16790 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms