Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTRK2Q16620 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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