Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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