Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYTH1Q15438 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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