Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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BRD3Q15059 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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BRD3Q15059 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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BRD3Q15059 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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BRD3Q15059 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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BRD3Q15059 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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BRD3Q15059 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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