Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD3Q15054 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms